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大分子营养物在消化道中降解为小分子可溶性单元营养素后，才能被肠上皮细胞吸收。对于某些营养素有专门的转运蛋白。但主要在吸收关口受调节的营养素只有铁和钙。含铁的血红素直接被吸收入上皮细胞，进入后再分解出铁。其他形式的铁要变为2价铁离子，可能还要形成某种螯合物再吸收入细胞;此外可能还存在主动吸收机制。铁可跨过细胞进入血流同转铁蛋白结合而被运走。多余的铁可与上皮细胞内的铁蛋白结合储存起来。

但上皮细胞寿命仅两三天，这些胞内铁储就随细胞的脱落而丢失。转铁蛋白的数量在缺铁及妊娠时增加从而起代偿作用。这些吸收环节的调节机制异常重要，因为人体缺乏排泄铁的机制。钙的调节有多重环节，但吸收环节也很重要。血钙降低时甲状旁腺激素增加，后者促进肾脏中1，25-二羟胆钙化醇的最后形成，钙化醇作用于肠上皮细胞中的DNA，引发合成一种钙结合蛋白，最后导致钙吸收的增加。